Kordosentez, gebelik sırasında 18. haftayı tamamladıktan sonra aynı amniosentez yapar gibi yapılan bir işlemdir. Farkı ise amnion suyundan örnek alınması değil de bebeğin göbek kordonundan kan alınmasıdır. Bunu yapmanın avantajı bebeğin genetik bir problemi olup olmadığının veya anne karnında enfeksiyon geçirip geçirmediğinin çok hızlı bir şekilde anlaşılmasıdır. Aynı zamanda bebeğe bu yolla kan veya ilaç verilebilir. Kordosentez ile bebeğin kan grubu, kan hastalıkları öğrenilebilir veya gelişme geriliği varsa sebeplerini açıklamaya yardımcı olur. Yüzde 1-2 oranında düşüğe sebep olabilir; bu nedenle ne için yapıldığının çok iyi bilinmesi, sonuçtan beklenen faydanın bu riske değmesi gerekmektedir. Deneyimli ellerde yapıldığında riskler minimuma inecektir.